Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Bco1Q9JJS6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Bco1Q9JJS6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Bco1Q9JJS6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Bco1Q9JJS6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Bco1Q9JJS6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Bco1Q9JJS6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Bco1Q9JJS6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Bco1Q9JJS6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Bco1Q9JJS6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Bco1Q9JJS6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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