Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a3Q9DC26 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a3Q9DC26 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms