Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc3Q9D6Y1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms