Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mrpl27Q99N92 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl27Q99N92 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl27Q99N92 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Mrpl27Q99N92 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Mrpl27Q99N92 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Mrpl27Q99N92 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl27Q99N92 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Mrpl27Q99N92 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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