Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx15Q91WE1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx15Q91WE1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms