Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit1Q8K099 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit1Q8K099 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms