Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot1Q6ZQ08 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot1Q6ZQ08 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms