Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC62Q6P9F0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms