Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Knl1Q66JQ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Knl1Q66JQ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Knl1Q66JQ7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Knl1Q66JQ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Knl1Q66JQ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Knl1Q66JQ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Knl1Q66JQ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Knl1Q66JQ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Knl1Q66JQ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Knl1Q66JQ7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms