Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mre11Q61216 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Mre11Q61216 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mre11Q61216 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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