Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms