Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain3Q3URJ8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms