Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ulk3Q3U3Q1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk3Q3U3Q1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms