Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy4Q3TYX8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy4Q3TYX8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy4Q3TYX8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy4Q3TYX8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy4Q3TYX8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rufy4Q3TYX8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy4Q3TYX8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms