Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TchpQ3TVW5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TchpQ3TVW5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TchpQ3TVW5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TchpQ3TVW5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TchpQ3TVW5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TchpQ3TVW5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms