Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 BNR1YIL159W 4128 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 RSE1YML049C 4086 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 PTP3YER075C 2787 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 DIG2YDR480W 972 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 HLR1YDR528W 1272 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 YEL010WYEL010W 351 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 YFL015CYFL015C 495 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 YFH7YFR007W 1062 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 YGL204CYGL204C 306 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 YGR111WYGR111W 1203 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 BAT1YHR208W 1182 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 VMA6YLR447C 1038 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 DIA1YMR316W 1011 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 YNL043CYNL043C 321 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 AIM4YBR194W 372 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 RIX1YHR197W 2292 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 YLR001CYLR001C 2589 nt2.54□□□□□ -2
RRP42Q12277 DSE4YNR067C 3354 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 VHR2YER064C 1518 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 AVT2YEL064C 1443 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 SAD1YFR005C 1347 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 SKO1YNL167C 1944 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 NRG1YDR043C 696 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 SEC4YFL005W 648 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 YIP5YGL161C 933 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 INP1YMR204C 1263 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 LCL1YPL056C 306 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 snR35snR35 204 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 MUB1YMR100W 1863 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 YKL100CYKL100C 1764 nt2.53□□□□□ -2
RRP42Q12277 CDC5YMR001C 2118 nt2.53□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YBR259WYBR259W 2067 nt2.53□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 AYT1YLL063C 1425 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 EAP1YKL204W 1899 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 PDR1YGL013C 3207 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 KAR1YNL188W 1302 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 SRB8YCR081W 4284 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 HPA3YEL066W 540 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YGL039WYGL039W 1047 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 CUP1-1YHR053C 186 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 CUP1-2YHR055C 186 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 LSM8YJR022W 330 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 SRL3YKR091W 741 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 MRPS8YMR158W 468 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YBL055CYBL055C 1257 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 MIC27YNL100W 705 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YPL276WYPL276W 438 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 FKS3YMR306W 5358 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 MET6YER091C 2304 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 SIN3YOL004W 4611 nt2.52□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 MDM36YPR083W 1740 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 UTP14YML093W 2700 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YLR446WYLR446W 1302 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YMR046CYMR046C 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 PSY2YNL201C 2577 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 FMN1YDR236C 657 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 EMI1YDR512C 564 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YHR212CYHR212C 336 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 DAD2YKR083C 402 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YAR060CYAR060C 336 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 RPL23AYBL087C 414 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 MPD2YOL088C 834 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 INO4YOL108C 456 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YOR277CYOR277C 309 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 RRG7YOR305W 729 nt2.51□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 VAC14YLR386W 2643 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 HAA1YPR008W 2085 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 MRPL32YCR003W 552 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YPD1YDL235C 504 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 CPR5YDR304C 678 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 COG7YGL005C 840 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 VEL1YGL258W 621 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 RPL24BYGR148C 468 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YJL169WYJL169W 369 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 THI80YOR143C 960 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 NOP56YLR197W 1515 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YJL132WYJL132W 2253 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 GEA1YJR031C 4227 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 CWC22YGR278W 1734 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 PDR3YBL005W 2931 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 MSH4YFL003C 2637 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YDR061WYDR061W 1620 nt2.5□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 URB2YJR041C 3525 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 RGR1YLR071C 3249 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 SRB7YDR308C 423 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YGL159WYGL159W 1113 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 DSE2YHR143W 978 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.49□□□□□ -2.01
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