Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sdr16c6Q05A13 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sdr16c6Q05A13 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms