Protein–RNA interactions for Protein: Q05789

ATG38, Autophagy-related protein 38, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG38Q05789 SRN2YLR119W 642 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 RPB8YOR224C 441 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 RPN4YDL020C 1596 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 SWR1YDR334W 4545 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 UBX3YDL091C 1368 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 MPC54YOR177C 1395 nt2.35□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 CET1YPL228W 1650 nt2.34□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 JIP5YPR169W 1479 nt2.34□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 FMN1YDR236C 657 nt2.34□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 YJL202CYJL202C 348 nt2.34□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 YKL070WYKL070W 510 nt2.34□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 SRT1YMR101C 1032 nt2.34□□□□□ -2.03
ATG38Q05789 HRD3YLR207W 2502 nt2.34□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 RTG3YBL103C 1461 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 APC11YDL008W 498 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 BET3YKR068C 582 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 PAU8YAL068C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 PDS5YMR076C 3834 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 RPL36AYMR194W 303 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 PAU20YOL161C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YOR203WYOR203W 354 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 FIG1YBR040W 897 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 PRM4YPL156C 855 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 JID1YPR061C 906 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 SLF1YDR515W 1344 nt2.33□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 SVL3YPL032C 2478 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 SNU114YKL173W 3027 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 APC2YLR127C 2562 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 HSC82YMR186W 2118 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 snR70snR70 164 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 PEX18YHR160C 852 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YOR055WYOR055W 435 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YSA1YBR111C 696 nt2.32□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YJL181WYJL181W 1836 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 SMC6YLR383W 3345 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 STH1YIL126W 4080 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 RGI2YIL057C 495 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 EMC6YLL014W 327 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YOL050CYOL050C 321 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YRO2YBR054W 1035 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 VMA9YCL005W-A 222 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 MLH1YMR167W 2310 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YDR061WYDR061W 1620 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 TCA17YEL048C 459 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 PEX4YGR133W 552 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 IKI1YHR187W 930 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 PRE8YML092C 753 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YOR097CYOR097C 528 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YPL276WYPL276W 438 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 ARO7YPR060C 771 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 DPB3YBR278W 606 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YNR066CYNR066C 1311 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 NUF2YOL069W 1356 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 TOR1YJR066W 7413 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YCT1YLL055W 1596 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 NOP56YLR197W 1515 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YDR203WYDR203W 318 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 HLR1YDR528W 1272 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 COBQ0105 1158 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 UPF3YGR072W 1164 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 MPC3YGR243W 441 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 SPO16YHR153C 597 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 BET5YML077W 480 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 IGO1YNL157W 507 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 ALG14YBR070C 714 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 COS111YBR203W 2775 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 PHO91YNR013C 2685 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 ERT1YBR239C 1590 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YCR064CYCR064C 411 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 YDL026WYDL026W 312 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 VPH2YKL119C 648 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 SAS2YMR127C 1017 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 BTS1YPL069C 1008 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 SCP160YJL080C 3669 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 ALY1YKR021W 2748 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG38Q05789 RGA2YDR379W 3030 nt2.28□□□□□ -2.05
ATG38Q05789 RAV1YJR033C 4074 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG38Q05789 RPS17AYML024W 411 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG38Q05789 AIM32YML050W 936 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG38Q05789 RSA1YPL193W 1146 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG38Q05789 RFC5YBR087W 1065 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG38Q05789 UTP15YMR093W 1542 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG38Q05789 YOL098CYOL098C 3114 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG38Q05789 VAC8YEL013W 1737 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG38Q05789 snR76snR76 109 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG38Q05789 RPL35BYDL136W 363 nt2.26□□□□□ -2.05
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