Protein–RNA interactions for Protein: Q04599

MRPL1, 54S ribosomal protein L1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 285 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL1	Q04599	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YGR228W	YGR228W	345 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RPL16A	YIL133C	600 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	ASG7	YJL170C	630 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	NNF1	YJR112W	606 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YLR171W	YLR171W	390 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	BER1	YLR412W	825 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	HHF1	YBR009C	312 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	HRD1	YOL013C	1656 nt		3.33	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	VHR1	YIL056W	1923 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	CHS3	YBR023C	3498 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	SSM4	YIL030C	3960 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RDS1	YCR106W	2499 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	APE2	YKL157W	2859 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YDL242W	YDL242W	354 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YDR431W	YDR431W	312 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	CGR1	YGL029W	363 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RPL9A	YGL147C	576 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RPS23A	YGR118W	438 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	TPM2	YIL138C	486 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YKT6	YKL196C	603 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YMR087W	YMR087W	855 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YBR012C	YBR012C	420 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RPS23B	YPR132W	438 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YGR237C	YGR237C	2358 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	MCM7	YBR202W	2538 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.32	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	ASI3	YNL008C	2031 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	WHI3	YNL197C	1986 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	SKO1	YNL167C	1944 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	AVT5	YBL089W	1380 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RSM24	YDR175C	960 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	MET32	YDR253C	576 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YDR269C	YDR269C	324 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	STE14	YDR410C	720 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RPL17B	YJL177W	555 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RNH203	YLR154C	333 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	HRI1	YLR301W	735 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YML003W	YML003W	873 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	ECM16	YMR128W	3804 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	DER1	YBR201W	636 nt		3.31	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	ZDS1	YMR273C	2748 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	ATG31	YDR022C	591 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YDR115W	YDR115W	318 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	MFA1	YDR461W	111 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	SEC53	YFL045C	765 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	CFD1	YIL003W	882 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RGI2	YIL057C	495 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	SGN1	YIR001C	753 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	VPH2	YKL119C	648 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	MCR1	YKL150W	909 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YMR052C-A	YMR052C-A	366 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	GPI15	YNL038W	690 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RPS7A	YOR096W	573 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	PEX1	YKL197C	3132 nt		3.3	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	AEP1	YMR064W	1557 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	PIN4	YBL051C	2007 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	CDC45	YLR103C	1953 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	STE24	YJR117W	1362 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	STU1	YBL034C	4542 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	PES4	YFR023W	1836 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RPA14	YDR156W	414 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	TDA2	YER071C	381 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	NSA2	YER126C	786 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	GET1	YGL020C	708 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YGR039W	YGR039W	312 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YHR138C	YHR138C	345 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	SDO1	YLR022C	753 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YAR047C	YAR047C	321 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RDN58-1	RDN58-1	158 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	RDN58-2	RDN58-2	158 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	MSS18	YPR134W	807 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	ANR2	YKL047W	1551 nt		3.29	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	ABP140	YOR239W	1887 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	SMC2	YFR031C	3513 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	TRX3	YCR083W	384 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	BNA7	YDR428C	786 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YER087C-A	YER087C-A	552 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	IES5	YER092W	378 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	EPT1	YHR123W	1176 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	DPH1	YIL103W	1278 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	OST6	YML019W	999 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	YOR105W	YOR105W	327 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	SHG1	YBR258C	429 nt		3.28	□□□□□ -1.88
MRPL1	Q04599	AVT2	YEL064C	1443 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	SEC27	YGL137W	2670 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	VBA4	YDR119W	2307 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	YKL075C	YKL075C	1353 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	15S_rRNA	15S_rRNA	1649 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	GAL80	YML051W	1308 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	HUL5	YGL141W	2733 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	YDL071C	YDL071C	375 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	SMT3	YDR510W	306 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		3.27	□□□□□ -1.89
MRPL1	Q04599	YIR020C-B	YIR020C-B	735 nt		3.27	□□□□□ -1.89

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