Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn6Q03958 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms