Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx1P70323 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx1P70323 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tbx1P70323 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms