Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	LIN1	YHR156C	1023 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	DAL2	YIR029W	1032 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	PRM6	YML047C	1059 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	TDA1	YMR291W	1761 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YTA7	YGR270W	4140 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	KIN82	YCR091W	2163 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YPS6	YIR039C	1614 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YNR063W	YNR063W	1824 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	EXO84	YBR102C	2262 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	HMO1	YDR174W	741 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	RSM18	YER050C	417 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	PGD1	YGL025C	1194 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YHR180W	YHR180W	492 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YIL046W-A	YIL046W-A	165 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YKL069W	YKL069W	543 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	TPK3	YKL166C	1197 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	REC102	YLR329W	795 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	NIP7	YPL211W	546 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YCL002C	YCL002C	792 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	TPO5	YKL174C	1857 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	REG1	YDR028C	3045 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	JJJ1	YNL227C	1773 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	CDC55	YGL190C	1581 nt		3	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	GWT1	YJL091C	1473 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	PFF1	YBR074W	2931 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	SLU7	YDR088C	1149 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	AIM11	YER093C-A	414 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YHR212C	YHR212C	336 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YKL123W	YKL123W	381 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	PIR1	YKL164C	1026 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	ENV10	YLR065C	546 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YAR060C	YAR060C	336 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	IMP4	YNL075W	873 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YNL184C	YNL184C	327 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YPR153W	YPR153W	423 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	MET6	YER091C	2304 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	REF2	YDR195W	1602 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	ECM29	YHL030W	5607 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YDR248C	YDR248C	582 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YFR009W-A	YFR009W-A	258 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	PXR1	YGR280C	816 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	VMA10	YHR039C-A	345 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YJL133C-A	YJL133C-A	225 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	ATG27	YJL178C	816 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YKL070W	YKL070W	510 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YKE2	YLR200W	345 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	PDR17	YNL264C	1053 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	PEX5	YDR244W	1839 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	PMR1	YGL167C	2853 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	NOP4	YPL043W	2058 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	RIX1	YHR197W	2292 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	SRD1	YCR018C	666 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YDL050C	YDL050C	372 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YDR209C	YDR209C	414 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	RSM28	YDR494W	1086 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YHR054C	YHR054C	1065 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	AGE2	YIL044C	897 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YIL141W	YIL141W	390 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	RPL15A	YLR029C	615 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	AFT2	YPL202C	1251 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YCL007C	YCL007C	393 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	ADF1	YCL058W-A	342 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	ATG13	YPR185W	2217 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	VAC14	YLR386W	2643 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	FUS2	YMR232W	2034 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	NUR1	YDL089W	1455 nt		2.96	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	MUB1	YMR100W	1863 nt		2.96	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	RTT105	YER104W	627 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YGR160W	YGR160W	612 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	RPL27A	YHR010W	411 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	AIM19	YIL087C	474 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	SDH3	YKL141W	597 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YKR011C	YKR011C	1062 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	GIM5	YML094W	492 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	GRE2	YOL151W	1029 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YOR277C	YOR277C	309 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	RPC40	YPR110C	1008 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	CIK1	YMR198W	1785 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	SMC2	YFR031C	3513 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	TFC4	YGR047C	3078 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YCR085W	YCR085W	354 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	FMN1	YDR236C	657 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	CDC26	YFR036W	375 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YFR054C	YFR054C	579 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YLR271W	YLR271W	825 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	MPD2	YOL088C	834 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	PFY1	YOR122C	381 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	YPL119C-A	YPL119C-A	264 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	EPL1	YFL024C	2499 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	MDM1	YML104C	3384 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	CHS3	YBR023C	3498 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	BSC1	YDL037C	987 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	CPR5	YDR304C	678 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	HLR1	YDR528W	1272 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	HPA3	YEL066W	540 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DSL1	P53847	RPB9	YGL070C	369 nt		2.94	□□□□□ -1.94

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