Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5cP41230 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm5cP41230 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm5cP41230 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms