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Protein–RNA interactions for Protein: P40317
SOK1, Protein SOK1, yeast
Predictions only
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901 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SOK1
P40317
RSM24
YDR175C
960 nt
2.11
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YET2
YMR040W
483 nt
2.11
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
MFA2
YNL145W
117 nt
2.11
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YOL050C
YOL050C
321 nt
2.11
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
RFM1
YOR279C
933 nt
2.11
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
POL30
YBR088C
777 nt
2.11
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YDR179W-A
YDR179W-A
1392 nt
2.1
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
SIP3
YNL257C
3690 nt
2.1
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
ATP22
YDR350C
2055 nt
2.1
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
APC11
YDL008W
498 nt
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□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YGR219W
YGR219W
342 nt
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□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
NOP19
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□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
FPR1
YNL135C
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□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YOR365C
YOR365C
2112 nt
2.1
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
KAP123
YER110C
3342 nt
2.1
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
SAS4
YDR181C
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□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
STN1
YDR082W
1485 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YKR015C
YKR015C
1707 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
RRP42
YDL111C
798 nt
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□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
SHU2
YDR078C
672 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YDR222W
YDR222W
1248 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
VTC1
YER072W
390 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YGR053C
YGR053C
852 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YHR097C
YHR097C
1101 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YAL042C-A
YAL042C-A
378 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
OMA1
YKR087C
1038 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YBL055C
YBL055C
1257 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
YBR259W
YBR259W
2067 nt
2.09
□□□□□ -2.07
SOK1
P40317
SSD1
YDR293C
3753 nt
2.09
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
SDC25
YLL016W
3147 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
snR57
snR57
88 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
YIL089W
YIL089W
618 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
YAL037W
YAL037W
804 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
RDN58-1
RDN58-1
158 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
RDN58-2
RDN58-2
158 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
GAB1
YLR459W
1185 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
TPT1
YOL102C
693 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
YBL005W-A
YBL005W-A
1323 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
YMR046C
YMR046C
1323 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
MSS4
YDR208W
2340 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
CLN3
YAL040C
1743 nt
2.08
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
LRS4
YDR439W
1044 nt
2.07
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
YEL057C
YEL057C
702 nt
2.07
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
DGK1
YOR311C
873 nt
2.07
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
SPS4
YOR313C
1017 nt
2.07
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
MGM1
YOR211C
2646 nt
2.07
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
PST1
YDR055W
1335 nt
2.07
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
PAF1
YBR279W
1338 nt
2.07
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
VPS9
YML097C
1356 nt
2.07
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
SPP41
YDR464W
4308 nt
2.06
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
SMC6
YLR383W
3345 nt
2.06
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
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YLL044W
447 nt
2.06
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
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YLR225C
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□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
SLM4
YBR077C
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2.06
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
PIN3
YPR154W
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2.06
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
NUP100
YKL068W
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□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
SEC16
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□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
NOP14
YDL148C
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P40317
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YFL057C
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P40317
RRF1
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YJL052C-A
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P40317
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YMR320W
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P40317
MON1
YGL124C
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COS111
YBR203W
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2.04
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
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YER044C
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□□□□□ -2.08
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P40317
MIG2
YGL209W
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□□□□□ -2.08
SOK1
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CIR1
YGR207C
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□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
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YKL162C
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2.04
□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
PAU8
YAL068C
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□□□□□ -2.08
SOK1
P40317
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□□□□□ -2.08
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YNL130C-A
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□□□□□ -2.08
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YBL094C
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□□□□□ -2.08
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YKR028W
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CRS5
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P40317
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YGL117W
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YAL069W
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YPL167C
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SOK1
P40317
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YDR524C
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2.01
□□□□□ -2.09
SOK1
P40317
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2.01
□□□□□ -2.09
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P40317
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□□□□□ -2.09
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SOK1
P40317
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YLR154W-A
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□□□□□ -2.09
SOK1
P40317
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YLR224W
1110 nt
2.01
□□□□□ -2.09
SOK1
P40317
PSP1
YDR505C
2526 nt
2.01
□□□□□ -2.09
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