Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTNP21246 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTNP21246 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTNP21246 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTNP21246 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTNP21246 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTNP21246 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms