Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoP15409 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoP15409 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoP15409 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoP15409 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoP15409 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoP15409 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RhoP15409 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoP15409 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoP15409 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoP15409 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoP15409 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoP15409 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoP15409 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoP15409 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoP15409 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoP15409 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoP15409 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhoP15409 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhoP15409 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhoP15409 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhoP15409 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoP15409 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms