Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Dkk1O54908 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Dkk1O54908 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms