Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf5O35326 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms