Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Smad7O35253 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Smad7O35253 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Smad7O35253 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad7O35253 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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