Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem200cJ3QK46 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms