Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms