Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms