Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20425E9Q035 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms