Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trappc8E9PWG2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms