Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a3A2ACT7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col9a3A2ACT7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms