Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms