Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Knop1Q9Z2Q2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms