Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl3Q9Z2M6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms