Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PnckQ9QYK9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PnckQ9QYK9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms