Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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