Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col5a3Q9JLI2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col5a3Q9JLI2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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