Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsph3bQ9DA80 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsph3bQ9DA80 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms