Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Subh2bvQ9D9Z7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Subh2bvQ9D9Z7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Subh2bvQ9D9Z7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Subh2bvQ9D9Z7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Subh2bvQ9D9Z7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Subh2bvQ9D9Z7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Subh2bvQ9D9Z7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Subh2bvQ9D9Z7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms