Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc8Q9CYA6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc8Q9CYA6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc8Q9CYA6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc8Q9CYA6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc8Q9CYA6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zcchc8Q9CYA6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zcchc8Q9CYA6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zcchc8Q9CYA6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc8Q9CYA6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms