Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg8Q8VE18 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smg8Q8VE18 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smg8Q8VE18 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smg8Q8VE18 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smg8Q8VE18 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smg8Q8VE18 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smg8Q8VE18 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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