Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit1Q8K099 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrit1Q8K099 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms