Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdcl3Q8BVF2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms