Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Grik4Q8BMF5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik4Q8BMF5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms