Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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USP30Q70CQ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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USP30Q70CQ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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USP30Q70CQ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP30Q70CQ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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