Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med16Q6PGF3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Med16Q6PGF3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms